Program Brother MFL-Pro Suite zahrnuje ovladač skeneru kompatibilní se standardem TWAIN. Ovladače TWAIN splňují standard univerzálního protokolu pro komunikaci mezi skenery a aplikacemi. To znamená, že kromě skenování obrázků přímo do prohlížeče PaperPort™ 11SE dodaného společností Brother společně s přístrojem, můžete skenovat obrázky také přímo do stovek jiných aplikací, které podporují skenování TWAIN. Mezi tyto aplikace patří oblíbené programy jako Adobe® Photoshop®, Adobe® PageMaker®, CorelDraw® a mnoho dalších.